El SISEM-SP actúa en cinco líneas de acción principales: Articulación Apoyo Técnico, Comunicación, Formación y Fomento. Estas líneas de acción fueron estructuradas con el objetivo de cualificar, perfeccionar y valorar las organizaciones y los acervos museológicos paulistas. Ellas son desarrolladas en asociación con otras unidades de la Secretaría de Cultura y Economía Creativa del Estado de São Paulo, las Organizaciones Sociales de Cultura – responsables por la gestión de los museos de la Secretaría – y Ayuntamientos municipales.

Una importante iniciativa es el apoyo del ProAC – Programa de Acción Cultural para el lanzamiento de decretos para el área de museos.